Дом » генетика » Почему Blast быстрее Fasta?

Почему Blast быстрее Fasta?

313
Последнее обновление: 2021-09-16 12:26:11


Ответить:
FASTA медленнее , чем BLAST , но предоставляет гораздо более широкий диапазон матриц оценок, что упрощает адаптацию поиска к конкретному эволюционному расстояние. Чрезвычайно быстрой , но значительно менее чувствительной альтернативой BLAST является BLAT ( Blast Like Alignment Tool). В этом отношении что такое Blast и Fasta? FASTA и BLAST . BLAST и FASTA - это две программы поиска сходства, которые идентифицируют гомологичные последовательности ДНК и белки на основе избыточного сходства последовательностей. Они предоставляют возможности для сравнения последовательностей ДНК и белков с существующими базами данных ДНК и белков. Также знайте, что означают результаты Blast? Как следует из названия, BLAST (базовый инструмент поиска локального выравнивания) разработан для определения локальных областей сходства последовательностей. Это означает , что BLAST может сообщать о нескольких дискретных областях сходства последовательностей между запросной последовательностью и предметной последовательностью в базе данных. В связи с этим, что такое взрыв и его типы? Существует множество различных вариантов поиска BLAST : BLASTP выполняет сравнение белок-белковых последовательностей, и его алгоритм является основой многих других < b> типы поиска BLAST , такие как BLASTX и TBLASTN. BLASTX выполняет поиск нуклеотидного запроса в базе данных белков, переводя запрос на лету. Что делает нуклеотидный бласт? Программа сравнивает нуклеотидные или белковые последовательности с базами данных последовательностей и вычисляет статистическую значимость совпадений. BLAST можно использовать для вывода функциональных и эволюционных взаимосвязей между последовательностями, а также для определения членов семейств генов.

ближайшая горячая точка
горячая классификация
Это может заинтересовать
up